El documental centra su tema principal en la relación causa-efecto entre la tecnología de microondas (causa) y el riesgo en la salud (efectos) y el conflicto de intereses en torno a este asunto.
Una amenaza invisible investiga el conflicto de intereses que se da entre los diferentes agentes que actúan en relación a la tecnología de microondas – industria, políticos, científicos y consumidores- y que provoca una indefensión ante los efectos sobre la salud por causa de esta radiación.